药物牙齿漂白的安全性得到了肯定。临床实践证明，牙齿漂白对牙龈和牙髓没有损伤，在牙医的指导下进行牙齿漂白是安全的。

但在牙齿漂白的过程中，部分患者会出现牙本质过敏、足跟刺激等副作用。但经过牙医进一步正确指导或缩短用药时间后，牙齿漂白会持续到整个疗程结束，症状消失，取得良好效果。

漂白牙齿的人会因为各种原因吞下一些漂白剂。但由于该药的浓度和剂量有限，至今尚未有毒性反应的报道。